Manwal għall-Utent iMed
Introduzzjoni
1.1. Għan
L-iskop ta 'dan web applikazzjoni hija li tieħu informazzjoni mhux ipproċessata u tippermetti li timmanipulaha b'mod li tagħti riżultati utli fit-teħid tad-deċiżjonijiet. Dan jista 'jkun li tħarreġ mudell b'dejta mhux ipproċessata jew li tbassar ir-riżultat bl-użu ta' mudelli u analiżi.
1.2. Menu tan-navigazzjoni
Il-menu tan-navigazzjoni fin-naħa ta’ fuq tal-paġna fih il-links kollha biex tasal fejn trid tkun. Jekk qatt tintilef, tista' dejjem tikklikkja l-vleġġa ta' wara biex tasal għal paġna familjari, tmur lura d-dar, jew issib il-paġna li qed tfittex fil-menu tan-navigazzjoni.
1.3. Kont
Jekk ma jkollokx kont diġà, trid tirreġistra biex tuża l-applikazzjoni. Biex tagħmel dan, ikklikkja l-buttuna tal-kont fin-naħa ta’ fuq tal-lemin u kklikkja fuq reġistru. Imbagħad daħħal l-isem tal-utent, il-password, u l-email tiegħek biex tipproċedi.
Jekk diġà għandek kont, idħol bl-username u l-password tiegħek.
Home Page
Billi tikklikkja fuq l-oġġetti fuq ix-xellug tal-paġna, deskrizzjoni ta’ kull wieħed se tidher fin-nofs tal-paġna biex tgħinek tifhem x’jagħmel kull wieħed.
iMedBot
L-applikazzjoni iMedBot tippreżenta interface li trawwem interazzjoni faċli tal-utent mal-aġenti, li tippermetti tbassir personalizzat u taħriġ tal-mudell. Isservi bħala l-ewwel pass lejn it-trasformazzjoni tar-riżultati tar-riċerka dwar it-tagħlim profond f'għodda onlajn, li għandha l-potenzjal li tqanqal riċerka addizzjonali f'dan il-qasam. Il-manwal tal-utent rispettiv tiegħu jista' jinstab hawn.
Analiżi tad-Dejta
4.1. Irkupra Subsets
Din it-taqsima tħalli lill-utent jeditja s-sett tad-dejta tiegħu. Tista' tagħżel li jew ittella sett ta' dejta ġdid jew tuża waħda eżistenti mill-menu drop-down.
Ladarba s-sett tad-dejta jkun ttella', tista' tagħżel liema azzjoni tixtieq tieħu billi tikklikkja waħda mill-għażliet fuq il-menu tan-naħa tax-xellug.
4.1.1. Irkupra Subsets Ibbażat fuq Filtri
Din it-taqsima tippermetti li tinkiseb subsett iżgħar tas-sett tad-dejta oriġinali bbażat fuq filtri mogħtija. Agħżel il-valuri li trid fis-subsett u mbagħad agħżel il-kolonni li trid murija fis-sett tad-dejta finali.
4.1.2. Ritorn Riżultati Sortjati
Dan jirritorna s-sett tad-dejta f'forma magħżula. Agħżel il-kolonna fil-mira, l-ordni tal-issortjar, in-numru ta 'ringieli li trid tirritorna, u liema kolonni turi fl-output finali.
4.1.3. Jespandi s-Sett tad-Data
Dan jippermetti lill-utent jespandi kolonna singular maħżuna bħala dizzjunarju f'tabella attwali li l-utent jista 'mbagħad jimmanipula. Huwa jieħu dataset nested u jċaqlaq dak li huwa meħtieġ mill-utent fis-saff ta 'fuq. L-ewwel, ittella sett tad-dejta li jinkludi kolonna b'sett tad-dejta ibbed. Jekk kolonna li teħtieġ tespandi tiġi skoperta awtomatikament, agħżel liema kolonna tespandi u liema kolonni tesprimi mill-informazzjoni mnaqqsa. Ikklikkja tissottometti u tista' view l-informazzjoni tiegħek bħala kolonni ta 'tabella minflok data nested.
4.2. Għaqda Files
Billi tagħżel u ttella’ settijiet ta’ dejta multipli billi tikklikkja bil-ktrl (kmand għal mac), dan jingħaqadhom f’sett ta’ dejta ikbar milli jintuża għal xi ħaġa oħra.
Agħżel id-datasets kollha u imla l-informazzjoni meħtieġa. Dan se jiffranka s-sett tad-dejta l-ġdid fl-applikazzjoni iMed u mbagħad ikun disponibbli biex jitniżżel.
4.3. Funzjonijiet tal-Plot
Din it-taqsima tħalli lill-utent jippjana s-sett tad-dejta tiegħu. Agħżel waħda mill-għażliet fuq il-menu tan-naħa tax-xellug u mbagħad imla l-oqsma meħtieġa biex tikseb il-plott tiegħek. Hawn taħt jinsabu t-tipi ta' plottijiet li tista' tagħmel mid-dejta tiegħek:
4.4. Analiżi Statistika
Din it-taqsima tħallina nwettqu testijiet statistiċi fuq is-sett tad-dejta tagħna. Agħżel test biex tmexxi mill-menu tan-naħa tax-xellug u imla l-oqsma biex tmexxi t-testijiet. Hawn taħt huma t-tipi ta 'testijiet li huma disponibbli:
ODPAC
5.1. Tgħallem
Din il-paġna tinkludi deskrizzjoni qasira ta’ kull tip ta’ riżors disponibbli f’din il-paġna. Meta tikklikkja l-buttuna fin-naħa ta' fuq ta' kull taqsima se torbot ma' paġna oħra li tippermetti lill-utent juża jew jitgħallem aktar dwar is-suġġett.
5.1.1. Epistażi
Din il-paġna tħallina nużaw MBS, algoritmu ta’ tfittxija biex nitgħallmu mid-dejta. Speċifikament, jippermettilna nistudjaw l-epistasi, l-interazzjoni bejn żewġ ġeni jew aktar li jaffettwaw il-fenotip. Dan huwa utli biex profile mard fl-aspett ġenetiku. Metodi konvenzjonali mhumiex adattati biex jimmaniġġaw id-dejta ta’ dimensjoni għolja misjuba fi studji ta’ assoċjazzjoni mal-ġenoma kollu (GWAS). L-algoritmu Multiple Beam Search (MBS) jippermetti li jinstabu ġeni li jinteraġixxu b'rata ħafna aktar mgħaġġla. Ittella d-dejta li trid tuża u mbagħad daħħal l-oqsma meħtieġa. Għal aktar informazzjoni fil-fond, sib il-karta sħiħa hawn.
5.1.2. Fatturi ta' Riskju
Din il-paġna tħallina nużaw il-pakkett IGain biex nitgħallmu l-interazzjonijiet bejn id-dejta. Jisgħallem speċifikament l-interazzjonijiet minn dejta ta’ dimensjoni għolja billi juża tfittxija euristika. Dan il-metodu jibni fuq il-metodu Exhaustive_IGain żviluppat qabel biex titgħallem l-interazzjonijiet minn dejta b'dimensjoni baxxa. Ittella d-dejta u mbagħad daħħal l-oqsma meħtieġa. Aktar informazzjoni dwar il-limiti tal-IS u l-iGain tista’ ssibha hawn.
5.1.3. Mudelli ta' Tbassir
Din it-taqsima tippermetti l-użu ta 'mudelli ta' tbassir diġà mibnija minn qabel fuq mudelli ta 'tagħlim tal-magni biex jitħaffef l-użu tiegħu. Dan jippermetti l-użu tagħhom mingħajr l-użu ta 'kodifikazzjoni u esperjenza minn qabel biex ibassru mudelli bl-użu tas-sett tad-dejta tagħhom stess. Hemm bosta mudelli ta 'tbassir disponibbli għall-utent inklużi Loġistika, Rigressjoni, Magni Vettur ta' Appoġġ (SVMs), Siġar tad-Deċiżjonijiet, u ħafna aktar. Il-lista sħiħa tal-metodi ta’ tbassir tinsab fuq in-naħa tal-lemin tal-paġna hawn.
5.2. Tbassir
Din it-taqsima tippermetti tbassir minn mudell kondiviż li ttella' qabel. L-ewwel ittella' mudell kondiviż jekk ma jkunx diġà sar. Imbagħad agħżel il-mudell li tuża għat-tbassir billi tikklikkja l-isem tal-mudell. Imbagħad ittella 'd-dejta għall-mudell ta' tbassir biex tuża. Dan jista' jsir jew manwalment billi tuża l-formola fil-qiegħ tal-paġna jew billi tuża l-mudell disponibbli biex jitniżżel. Jekk tuża l-mudell, ittella s-sett tad-dejta file u kklikkja tissottometti biex tirċievi t-tbassir tal-mudell.
5.3. Appoġġ għal Deċiżjoni
L-appoġġ għad-deċiżjonijiet jipprovdi klassifikazzjoni u jista' jiggwida l-għażliet tat-trattament mill-informazzjoni pprovduta lis-sistema. Ġie mħarreġ mid-dejta biex jirrakkomanda l-aħjar proċedura ta 'trattament ibbażata fuq il-karatteristiċi tal-pazjent. Aktar informazzjoni dwar Sistemi ta’ Appoġġ għal Deċiżjonijiet Kliniċi (CDSS) tista’ tinstab hawn.
Ir-Rakkomandazzjoni tas-Sistema tieħu l-karatteristiċi tal-pazjent u tirrakkomanda proċedura ta 'trattament u tbassar il-probabbiltà futura ta' metastasi ta '5 snin. L-Intervent tal-Utent jieħu kemm il-karatteristiċi tal-pazjent kif ukoll il-proċedura tat-trattament biex ibassar il-probabbiltà futura ta 'metastasi ta' 5 snin ibbażata fuq trattament attwali minflok trattament ottimali.
MBIL
Il-Markov Blanket and Interactive Risk Factor Learner (MBIL) huwa algoritmu li jitgħallem fatturi ta 'riskju singoli u interattivi li għandhom influwenza diretta fuq ir-riżultat ta' pazjent. Ikklikkja "mur għal MBIL" biex tiġi ridirett lejn l-Indiċi tal-Pakketti Python (PyPI) għall-pakkett MBIL li jinsab hawn. Aktar informazzjoni dwar MBIL tista 'tinstab fuq BMC Bioinformatics.
Settijiet tad-dejta
Din it-taqsima tippermetti lill-utent biex jara u jtella settijiet ta' dejta ġodda fil- web applikazzjoni.
7.1. Ara s-Settijiet tad-Dejta Kollha Disponibbli
Biex tara s-settijiet tad-dejta kollha disponibbli, sempliċement ikklikkja "Uri s-settijiet tad-dejta disponibbli."
7.2. Ittella Sett tad-Data
Biex ittella sett tad-dejta, ikklikkja "Aqsam is-settijiet tad-dejta tiegħek" u mbagħad imla l-informazzjoni meħtieġa kif iddikjarat fuq webpaġna. L-ewwel, ittella d-dataset u imla l-oqsma meħtieġa.
Imbagħad, imla l-oqsma hawn taħt jew ittella’ test file bl-informazzjoni mimlija. An exampLe ta' kif torganizza l-informazzjoni sabiex l-applikazzjoni tkun tista' tifhimha huwa mogħti hawn taħt.
Mudelli
Din it-taqsima tippermetti lill-utent biex jara mudelli disponibbli għalihom u jaqsam mudell.
8.1. Ara l-Mudelli Kollha Disponibbli
Biex tara l-mudelli kollha disponibbli, ikklikkja "Uri Mudelli Disponibbli."
8.2. Aqsam Mudell
Biex taqsam mudell, ikklikkja fuq “Share Your Models” u mbagħad ittella’ mudell file mħarrġa minn tensor flow jew PyTorch.
8.2.1. Sett tad-Data Relatati
Imbagħad għandek ittella s-sett tad-dejta relatat li jinkludi l-intestaturi. Il-klassi/it-tikketta għas-sett tad-dejta għandha tkun fl-aħħar kolonna.
8.2.2. Tbassir u informazzjoni tal-Klassi
Jekk is-sett tad-dejta jinkludi l-karatteristiċi kollha, il-formola tal-karatteristiċi tista’ tinqabeż wara li ttella’ s-sett tad-dejta. Madankollu, jekk mhumiex inklużi kollha, din l-informazzjoni għandha tiġi pprovduta fid-deskrizzjoni file jew fil-forma tal-karatteristika. Agħżel l-għażla mill-drop down li tindika kif biħsiebek tipprovdi t-tbassir u l-informazzjoni tal-klassi.
Jekk tuża l-għażla tad-deskrizzjoni, tista' jew timla l-oqsma jew ittella' test file bl-informazzjoni mimlija. An exampLe ta' kif torganizza l-informazzjoni hija mogħtija hawn taħt.
Dokumenti / Riżorsi
 |
Apps iMed Web Applikazzjoni [pdfManwal tal-Utent iMed, iMed Web Applikazzjoni, Web Applikazzjoni |